A Sands of Time trilógia záró epizódjaként a Prince of Persia The Two Thrones keretein belül a Herceg újabb nagy kalandra indul. Miután a mi segítségünkkel legyőzte Dahakát és megmentette Kaileenát, most egy minden eddiginél nagyobb és veszélyesebb háború vár rá.
A Prince of Persia The Two Thrones a játékmenet tekintetében a korábbi részek vonalát követi, a hangsúly tehát ezúttal is a brutális, kombó-alapú harcokon, valamint az akrobatikus elemeken lesz, kibővítve a logikai feladványokkal, csapdákkal, valamint természetesen az idő manipulálásának elmaradhatatlan lehetőségével.